たとえば*1のように。
((ここに$hogeと書く))
html.php/inline()中で
$replace = $remove ? '' : 'make_note("$1")';
としていて、$1がダブルクオート囲み(変数展開される対象)のため、変数部分が未定義のまま空文字列として展開されているようです。
- $replace = $remove ? '' : 'make_note("$1")'; + $replace = $remove ? '' : 'make_note(\'$1\')';