$autolinkの設定値を大きく(例えば$autolink=80)しすぎると、何も表示されなくなってしまいます。
get_autolink_pattern関数の戻り値が、正常終了の時は arrayなのに対し、該当するページが無い場合は下記のようにarrayでは無いのが原因のようです。
lib/func.php: 477行目付近 if (empty($auto_pages)) return $nowikiname ? '(?!)' : $WikiName;
BugTrack2/2を実装中に見つけました (^^;