PukiWiki-officialのcharsetの表記が
<meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=EUC_JP">
になってますが、正しくは
<meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=euc-jp">
です。このため、IEでアクセスするとShift_JISと誤認識してしまいます。
<!doctype html public "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/html4/loose.dtd">