$defaultpageを[[プロジェクト]]にすると、[トップ]をクリックしたときに、「プ・糎ェクト の編集」というページに行ってしまいます。
[トップ]のリンクだけURLエンコードしてないのが原因だと思い、html.phpの最初のほうを以下のように書き換えたら文字化けが直りました。
修正前)$link_top = "$script?$defaultpage";
修正後)$link_top = "$script?".rawurlencode($defaultpage);
1.3.3とCVSにあるもの両方で文字化けしました。文字化けするのはIE5.5を使ったときです。Opera7とphoenix(mozilla系のブラウザです)では文字化けしませんでした。